Graph clustering by flow simulation phd thesis

Graph clustering by flow simulation phd thesis

Based on the PhD thesis by Stijn van Dongen Van Dongen, S. () Graph Clustering by Flow Simulation. PhD Thesis, University of Utrecht, The Netherlands. MCL is a graph clustering algorithm. MCL is freely available for download at blogger.com account of the main contribution of the thesis, the Markov Cluster Process,aclusterpro-cess designed within the setting of graphs. This setting defines a relatively young area in cluster analysis referred to as graph clustering, which has connections to the clearly scoped field of graph partitioning. Clustering and graph-clustering methods are also Andrea Marino Graph Clustering Algorithms. Given a graph and a clustering, a quality measure should behave as follows: more intra-edges)higher quality Graph Clustering by Flow Simulation. PhD thesis, University of Utrecht, May Andrea Marino Graph Clustering Algorithms. Markov Clustering Algorithm

Graph Clustering By Flow Simulation Phd Thesis

Graph clustering by flow simulation. Dit proefschrift heeft als onderwerp het clusteren van grafen door middel van simulatie van stroming, een probleem dat in zijn algemeenheid behoort tot het gebied der clusteranalyse, graph clustering by flow simulation phd thesis. In deze tak van wetenschap ontwerpt en onderzoekt men methoden die gegeven bepaalde data een onderverdeling in groepen genereren, waarbij het oogmerk is een read more onderverdeling in groepen te vinden die natuurlijk is.

Dat wil zeggen dat verschillende data-elementen in dezelfde groep idealiter veel op elkaar lijken, en dat data-elementen uit verschillende groepen idealiter veel van elkaar verschillen. Soms ontbreken zulke groepjes helemaal; dan is er weinig patroon te herkennen in de data.

Het idee is dat de aanwezigheid van natuurlijke groepjes het mogelijk maakt de data te categoriseren. Een voorbeeld is het clusteren van gegevens over symptomen of lichaamskarakteristieken van patienten die aan dezelfde ziekte lijden.

Als er duidelijke groepjes bestaan in die gegevens, kan dit tot extra inzicht leiden in de ziekte, graph clustering by flow simulation phd thesis. Clusteranalyse kan aldus gebruikt worden voor exploratief onderzoek. Verdere voorbeelden komen uit de scheikunde, taxonomie, psychiatrie, archeologie, marktonderzoek en nog vele andere disicplines.

Taxonomie, de studie van de classificatie van organismen, heeft een rijke geschiedenis beginnend bij Aristoteles en culminerend in de werken van Linnaeus. In feite kan de clusteranalyse gezien graph clustering by flow simulation phd thesis als het resultaat van een steeds meer systematische en abstracte studie van de diverse methoden ontworpen in verschillende toepassingsgebieden, waarbij methode zowel wordt gescheiden van data en toepassingsgebied als van berekeningswijze.

In de cluster analyse kunnen grofweg twee richtingen onderscheiden worden, naar gelang het type data dat geclassificeerd moet worden. De data-elementen in het voorbeeld hierboven worden beschreven door vectoren lijstjes van scores of metingenen het verschil tussen twee elementen wordt bepaald door het verschil van de vectoren. Voorbeelden komen uit de patroonherkenning, het computer ondersteund ontwerpen, databases voorzien van hyperlinks en het World Wide Web.

Een stelsel van punten samen met hun verbindingen heet een graaf. Een goede clustering van een graaf deelt de punten op in groepjes zodanig dat er weinig verbindingen lopen tussen punten uit verschillende groepjes en er veel verbindingen zijn in elk groepje afzonderlijk. show less. See more statistics about this item.

Lecture 34 — Spectral Clustering Three Steps (Advanced) - Stanford University

, time: 7:18

Graph clustering by flow simulation. Dongen, S.M. van. () Utrecht University Repository. (Dissertation) Abstract. Dit proefschrift heeft als onderwerp het clusteren van grafen door middel van simulatie van stroming, een probleem dat in zijn algemeenheid behoort tot het gebied der clusteranalyse. In deze tak van wetenschap ontwerpt en Cited by: Andrea Marino Graph Clustering Algorithms. Given a graph and a clustering, a quality measure should behave as follows: more intra-edges)higher quality Graph Clustering by Flow Simulation. PhD thesis, University of Utrecht, May Andrea Marino Graph Clustering Algorithms. Markov Clustering Algorithm PhD thesis, University of Utrecht, May Stijn van Dongen. Graph clustering via a discrete uncoupling process. SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications 30, Van Dongen S () Graph clustering by flow simulation/10()